MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 1230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007765	TCT	3	9	63	71	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007765	CTTC	2	8	72	79	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007765	TTG	2	6	88	93	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007765	GGAA	2	8	124	131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007765	GC	3	6	3474	3479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007765	CGGCA	2	10	3493	3502	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007765	A	7	7	3502	3508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007765	GGA	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007765	GA	3	6	3519	3524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007765	GCC	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007765	GA	3	6	6899	6904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007765	CGA	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007765	CCG	2	6	6970	6975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007765	GC	4	8	6995	7002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007765	GA	4	8	9629	9636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007765	C	6	6	17226	17231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_007765	CTC	2	6	17269	17274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007765	CTC	2	6	17276	17281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007765	TCAAC	2	10	17291	17300	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007765	GGTT	2	8	17306	17313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007765	TTC	2	6	17332	17337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007765	AAT	2	6	18709	18714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007765	GC	3	6	18747	18752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007765	CCT	2	6	18788	18793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007765	A	7	7	18828	18834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007765	GGCA	2	8	18889	18896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007765	GCT	2	6	18899	18904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007765	CTT	2	6	18915	18920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007765	CAG	2	6	20149	20154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007765	AATT	2	8	20161	20168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007765	CG	3	6	20216	20221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007765	ATC	2	6	20226	20231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007765	GCG	2	6	20251	20256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007765	CAC	2	6	20298	20303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007765	GAA	2	6	21559	21564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007765	CG	3	6	21572	21577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007765	CGG	2	6	21587	21592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007765	GCG	2	6	21593	21598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007765	TCC	2	6	23994	23999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007765	CTT	2	6	24022	24027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007765	GGTA	2	8	24073	24080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007765	CGG	2	6	24085	24090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007765	GAC	2	6	24105	24110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007765	CGGT	2	8	24163	24170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007765	GCT	2	6	24172	24177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007765	CGC	2	6	24268	24273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007765	A	6	6	24277	24282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007765	AGG	2	6	24635	24640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007765	GCA	2	6	24649	24654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007765	GTTC	2	8	24663	24670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007765	TCC	2	6	26619	26624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007765	GGT	2	6	26641	26646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007765	CG	3	6	26648	26653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007765	TC	3	6	26783	26788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007765	CGATG	2	10	28495	28504	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007765	TCG	2	6	28632	28637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007765	CG	3	6	28636	28641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007765	GCT	2	6	28654	28659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007765	TG	3	6	28680	28685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007765	GCC	2	6	28805	28810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007765	GC	3	6	28835	28840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007765	GGGT	2	8	28841	28848	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007765	GA	3	6	28884	28889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007765	CGA	2	6	29861	29866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007765	GGC	2	6	29995	30000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007765	GCG	2	6	30019	30024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007765	TTTG	2	8	30033	30040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007765	T	6	6	30054	30059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007765	TCG	2	6	30143	30148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007765	GCC	2	6	30179	30184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007765	GCG	2	6	30198	30203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007765	TCGA	2	8	30267	30274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007765	GGC	2	6	33730	33735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007765	GCG	2	6	35784	35789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007765	GCC	3	9	35792	35800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_007765	AAC	2	6	38843	38848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007765	AGC	2	6	40018	40023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007765	TTG	2	6	40080	40085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007765	GCA	2	6	40148	40153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007765	ATC	2	6	40176	40181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007765	AT	3	6	40249	40254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007765	T	6	6	40313	40318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007765	TGA	3	9	40342	40350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007765	GAG	2	6	40433	40438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007765	GCCC	2	8	41791	41798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_007765	ATT	2	6	41958	41963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007765	CGC	2	6	42002	42007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007765	CGC	2	6	43326	43331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007765	CGGGA	2	10	46106	46115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007765	CCG	2	6	46148	46153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007765	ACG	2	6	48602	48607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007765	GCG	2	6	48616	48621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007765	GGC	2	6	48623	48628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007765	GGCG	2	8	49908	49915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007765	GCC	2	6	49930	49935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007765	TCT	2	6	55935	55940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007765	TGA	2	6	55989	55994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007765	GAA	2	6	56035	56040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007765	GCA	2	6	57553	57558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007765	GCT	2	6	60556	60561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007765	TCA	2	6	60631	60636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007765	AGG	2	6	61161	61166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007765	GC	3	6	61721	61726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007765	CGC	2	6	61771	61776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007765	GCC	2	6	61780	61785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007765	GCA	2	6	61786	61791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007765	CTTC	2	8	61801	61808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007765	ACG	2	6	61889	61894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007765	GGTT	2	8	61896	61903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007765	ATC	2	6	61917	61922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007765	CGC	2	6	61931	61936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007765	TGC	2	6	61956	61961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007765	GCG	3	9	61991	61999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007765	GCC	2	6	62038	62043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007765	ATG	2	6	62044	62049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007765	TCT	2	6	62071	62076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007765	AGC	2	6	62107	62112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007765	CG	3	6	64836	64841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007765	T	6	6	64935	64940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007765	CG	3	6	64941	64946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007765	AGCG	2	8	64949	64956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007765	GTCT	2	8	64971	64978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007765	AGC	2	6	66839	66844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007765	GGC	2	6	67708	67713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007765	ATCGTA	2	12	69042	69053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_007765	AGC	2	6	69070	69075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007765	GAA	3	9	69127	69135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007765	TGGT	2	8	69184	69191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007765	GCT	2	6	69205	69210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007765	CGGG	2	8	69211	69218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007765	CGC	2	6	69294	69299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007765	GCC	2	6	69308	69313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007765	GCC	2	6	70422	70427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007765	TCAGT	2	10	73168	73177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007765	CGG	2	6	73178	73183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007765	GCC	2	6	73200	73205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007765	CTT	2	6	74343	74348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007765	CCG	3	9	76262	76270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007765	CTT	2	6	76292	76297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007765	CGA	2	6	76322	76327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007765	TGA	2	6	76329	76334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007765	AGC	2	6	76349	76354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007765	GCC	2	6	76355	76360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_007765	CCG	2	6	76397	76402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_007765	GCC	2	6	76419	76424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_007765	AGCG	2	8	76456	76463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_007765	CGT	2	6	76599	76604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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